Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms