Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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