Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STAMBPL1Q96FJ0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms