Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms