Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL4Q96C24 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms