Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT35Q92764 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms