Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2Q8WZ74 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms