Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms