Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AVL9Q8NBF6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms