Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms