Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUFY3Q7L099 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUFY3Q7L099 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUFY3Q7L099 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms