Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L3Q6VB84 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms