Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms