Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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