Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms