Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms