Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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