Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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IRF4Q15306 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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