Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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