Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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