Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms