Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms