Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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