Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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