Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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