Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms