Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms