Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNDQ07001 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms