Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms