Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms