Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFM1P61960 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms