Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI2P48788 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms