Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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