Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms