Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms