Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLD1P28340 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms