Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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APCP25054 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APCP25054 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
APCP25054 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
APCP25054 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
APCP25054 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APCP25054 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
APCP25054 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APCP25054 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APCP25054 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APCP25054 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APCP25054 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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