Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRDP23468 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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