Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF1P22415 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF1P22415 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF1P22415 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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