Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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