Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME1P15531 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms