Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms