Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms