Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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