Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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