Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms