Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms