Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 375 ms