Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms