Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms